Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fgfr1opQ66JX5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fgfr1opQ66JX5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms