Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q66JV7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q66JV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q66JV7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q66JV7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q66JV7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q66JV7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Q66JV7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q66JV7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q66JV7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q66JV7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q66JV7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q66JV7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q66JV7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q66JV7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms