Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lrrc8eQ66JT1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrc8eQ66JT1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrc8eQ66JT1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms