Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Top2bQ64511 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Top2bQ64511 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Top2bQ64511 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Top2bQ64511 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms