Protein–RNA interactions for Protein: Q64442

Sord, Sorbitol dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SordQ64442 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SordQ64442 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SordQ64442 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SordQ64442 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SordQ64442 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SordQ64442 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SordQ64442 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SordQ64442 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SordQ64442 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SordQ64442 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SordQ64442 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SordQ64442 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SordQ64442 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SordQ64442 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SordQ64442 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SordQ64442 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SordQ64442 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SordQ64442 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SordQ64442 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SordQ64442 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SordQ64442 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SordQ64442 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms