Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PatjQ63ZW7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PatjQ63ZW7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PatjQ63ZW7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms