Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga3Q62470 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga3Q62470 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms