Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CcncQ62447 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CcncQ62447 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcncQ62447 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcncQ62447 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms