Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpd52Q62393 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpd52Q62393 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpd52Q62393 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms