Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Kdm5dQ62240 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Kdm5dQ62240 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Kdm5dQ62240 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
Kdm5dQ62240 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms