Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sycp1Q62209 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sycp1Q62209 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms