Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sf3a2Q62203 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sf3a2Q62203 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms