Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PrkciQ62074 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PrkciQ62074 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms