Protein–RNA interactions for Protein: Q61923

Kcna6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna6Q61923 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcna6Q61923 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcna6Q61923 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kcna6Q61923 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kcna6Q61923 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kcna6Q61923 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kcna6Q61923 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kcna6Q61923 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms