Protein–RNA interactions for Protein: Q61809

Lrrn1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, mousemouse

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn1Q61809 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lrrn1Q61809 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lrrn1Q61809 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms