Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itga6Q61739 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga6Q61739 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga6Q61739 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms