Protein–RNA interactions for Protein: Q61645

Hr, Lysine-specific demethylase hairless, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrQ61645 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HrQ61645 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HrQ61645 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HrQ61645 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HrQ61645 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HrQ61645 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HrQ61645 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrQ61645 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrQ61645 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrQ61645 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrQ61645 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrQ61645 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrQ61645 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrQ61645 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HrQ61645 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HrQ61645 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HrQ61645 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HrQ61645 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms