Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Grik5Q61626 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Grik5Q61626 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik5Q61626 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms