Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gli3Q61602 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gli3Q61602 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms