Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dsg1aQ61495 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dsg1aQ61495 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dsg1aQ61495 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms