Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd1Q61345 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Foxd1Q61345 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms