Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irf9Q61179 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Irf9Q61179 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Irf9Q61179 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms