Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HarsQ61035 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HarsQ61035 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HarsQ61035 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms