Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Klf3Q60980 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klf3Q60980 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms