Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kpna1Q60960 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kpna1Q60960 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kpna1Q60960 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms