Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Neurod1Q60867 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Neurod1Q60867 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Neurod1Q60867 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms