Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cdkn2dQ60773 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cdkn2dQ60773 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdkn2dQ60773 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms