Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csnk2a1Q60737 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csnk2a1Q60737 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms