Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Samhd1Q60710 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Samhd1Q60710 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms