Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SkiQ60698 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SkiQ60698 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SkiQ60698 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SkiQ60698 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms