Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PmelQ60696 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PmelQ60696 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PmelQ60696 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms