Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sin3aQ60520 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sin3aQ60520 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sin3aQ60520 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms