Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp13a3Q5XF89 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp13a3Q5XF89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp13a3Q5XF89 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms