Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Scaf1Q5U4C3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Scaf1Q5U4C3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Scaf1Q5U4C3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms