Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cdcp1Q5U462 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdcp1Q5U462 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdcp1Q5U462 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms