Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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Trim38Q5SZ99 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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Trim38Q5SZ99 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trim38Q5SZ99 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Trim38Q5SZ99 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Trim38Q5SZ99 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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Trim38Q5SZ99 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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Trim38Q5SZ99 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Trim38Q5SZ99 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trim38Q5SZ99 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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