Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Specc1Q5SXY1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Specc1Q5SXY1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Specc1Q5SXY1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms