Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ssh2Q5SW75 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ssh2Q5SW75 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ssh2Q5SW75 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ssh2Q5SW75 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms