Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW19

Cluh, Clustered mitochondria protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluhQ5SW19 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CluhQ5SW19 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CluhQ5SW19 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CluhQ5SW19 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms