Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r196Q5SVD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r196Q5SVD5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r196Q5SVD5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms