Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ankrd40Q5SUE8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd40Q5SUE8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms