Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Sco1Q5SUC9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sco1Q5SUC9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sco1Q5SUC9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.1 ms