Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4930512M02RikQ5SQK8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930512M02RikQ5SQK8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930512M02RikQ5SQK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms