Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc85aQ5SP85 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc85aQ5SP85 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc85aQ5SP85 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms