Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trdv2-2Q5R1A4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms