Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hs3st6Q5GFD5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hs3st6Q5GFD5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms