Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp22Q5DU02 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usp22Q5DU02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp22Q5DU02 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms