Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f8Q58FA4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E2f8Q58FA4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms