Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prss53Q571E5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prss53Q571E5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss53Q571E5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms