Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem171Q4KL18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem171Q4KL18 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms